pacBio公司每年都会举办SMRT资助活动。今年的SMRT动植物资助(2021 plant and Animal SMRT Grant)活动将为科学家提供免费的pacBio测序,以支持农业基因组学的发现。活动自宣布以来,收到了来自世界各地的数百份申请。

在研究动植物时,研究人员可以利用单倍型解析的基因组来更好地探索进化和功能变异。通过单倍型解析的泛基因组,科学家们能够将性状与单倍型相关联,在整个群体范围内捕获结构变异,并破译标志物开发所需的复杂性状。

今年的SMRT动植物资助获得者将有机会使用突破性的Sequel IIe系统,对喜爱的植物或动物进行遗传分析。具体包括生物信息学的支持、SMRTbell文库制备和最多6张8M SMRT芯片的免费测序。据悉,这也是首次在SMRT资助活动中使用Circulomics进行高分子量DNA提取。

pacBio近日宣布,三名研究人员获得了此次活动的资助,其中包括加拿大苹果多样性实验室(Apple Diversity Lab)的首席研究员Sean Myles博士。

Myles博士及其团队,包括研究员Zoë Migicovsky、Sophie Watts和Tom Davies,正在安纳波利斯山谷研究苹果的巨大多样性,努力培育出美味且需要较少化学物质即可生长的新品种。他们所做的工作对未来的粮食生产至关重要。

在获得资助后,Zoë、Sophie和Tom计划对他们果园中种植的苹果进行泛基因组测序和组装。这个苹果生物多样性果园中有1000多个独特的栽培品种,是世界上最多样化的果园之一。

为了最大限度地增加单倍型的数量,他们使用了一种名为SV Collector的工具来鉴定10个能准确代表果园遗传多样性的个体。在建立这个强大的单倍型解析泛基因组之后,他们计划用这些数据来保护苹果的生物多样性,并更好地将成熟时间、开花时间和糖含量等复杂性状与基因和结构变异等关联起来。

pacBio表示:“我们对苹果多样性实验室所做的工作感到非常兴奋,并十分荣幸能够通过今年的SMRT动植物资助来支持他们的努力。”