proseeker,一种新型计算工具,它可以模拟自然选择过程,产生可用于一系列医疗和家庭用途的蛋白质。

洗衣粉中的酶、糖尿病药物中的胰岛素或癌症治疗中使用的抗体,目前都是在实验室中通过一种被称为定向进化的艰苦过程制造出来的。

实验室进化模仿自然进化,在自然来源的蛋白质中进行突变,然后选择最好的突变体,再进行突变和再次选择,这是一个耗时费力的过程,创造出有用的蛋白质。

ARC合成生物学卓越中心的科学家们现在已经发现了一种方法,可以用计算机完成整个定向进化过程。它可以将所需的时间从几个月甚至几年减少到几天。

该研究小组由科廷大学的Oliver Rackham教授领导,与西澳大利亚大学的Aleksandra Filipovska教授合作,位于西澳大利亚珀斯的Harry perkins医学研究所。

为了证明这个过程有多有用,他们取了一种没有任何功能的蛋白质,并赋予它与DNA结合的能力。

Rackham教授说:“结合DNA的蛋白质目前正在彻底改变基因治疗领域,科学家正利用它们逆转致病突变。所以这在未来会很有用。”

“重构定向进化的整个过程代表了该领域的一个根本性进步。”

文章发表在《Nature Chemical Biology》杂志。

Randomized controlled/clinical trial